人間ドックに関する基本的な考え方は、「長い航海をした船はドックに入れ、船底についた貝殻をとりのぞき船体を塗りかえ、機関部などをチェックし、具合の悪い箇所を直して再び航海に出ます。これと同じように、人生の長い航海をしてきた人々も、たとえ自分ではわからなくてもドックに入り、具合の悪いところがないかどうかを調べ、もしあればその故障したところを早めに治し、故障がなければ健康に自身を得てまた人生の航路に出発する」(健康保険組合連合会作『短期人間ドック案内』より)と記されています。
自動化総合健診は、午前中に健診専用フロアで、自動化された各種の検査機器、自動計測機器などを使用して、多人数を対象に多項目の検査を効率的に行います。午後には、コンピュータに登録された結果データをもとに、医師と看護師による結果面接および生活指導が行われています。