墓地の維持管理は各国領事団がという明治政府の方針で明治3年に管理委員会が結成され、明治33年4月に財団法人横浜外国人墓地として法人化されましたが、公益財団法人となった今もそのスタイルは変わっていません。
「横浜外国人墓地資料館」も併設され、墓地に埋葬されたなかで、経歴などが判明している約300人資料を公開しています。
例年、3月末〜12月の土・日曜、祝日(12:00〜16:00、雨天の場合は除く)に実施される維持管理のための募金活動期間に、募金に協力した場合に入苑が可能となっています。