13歳の少女アリシアが誘拐される。現場を目撃していたのは姉のエイプリルだったが、その証言にはいくつか不審な点があり、また母親の着ていたシャツには血痕があった。近隣には性犯罪の前歴を持つ者が居住しており、いったんは彼に疑いが向けられるが、同時にアリシアの家庭の複雑な事情も明らかにされていく。
キャサリンとニックはホテルのスイートルームで発見された変死体の事件を担当。腕の斑点からエボラ出血熱が疑われるが、それはシミを除去するためのレーザー施術と判明。グリッソム、サラ、グレッグはシロアリ駆除中の家の中で家主が死亡していた事件を担当。危険な薬品を散布していることはわかっていたはずなのに、なぜ家主は家に戻ったのか。
西ラスベガス大学のキャンパスに大量の蛆虫が発生。蛆虫の大群の中から人間の骨や歯が発見されたことから、殺人事件の疑いが生じる。同大学では20年前から断続的に殺人事件が発生しており、それらの事件との関連を思わせる証拠も見つかっていた。連続殺人犯が再び活動を開始したのか。
高校の学園祭が行われていたホテル。その最上階のスイートルームで、女子生徒が死亡した。一緒にいた生徒の話では、部屋に入って来ていきなり嘔吐して倒れたというのだが、現場の状況にはその話と矛盾する点があった。また、同じ高校の生徒でホテルのオーナーの娘でもある少女が行方不明になっていた。
5年前にグリッソムが扱った事件が、裁判手続き上の不備を理由に再審されることになった。グリッソムは再び証言台に立つが、そこで目にした証拠品には、5年前には確認できなかった指紋が浮かび上がっていた。グリッソムはキャサリンに5年前の証拠をすべて調べ直すように指示する。一方、サラとグレッグは銃で足を撃たれて死亡した男の事件を捜査する。
グレイヴヤードシフトは虐待されて死亡した男児の事件を担当。銃撃現場へ捜査に行き、偶然に遺体を発見したのだ。スイングシフトは留置場で暴動が起き、被疑者の一人が死亡した事件を担当。留置場の環境が劣悪なうえ、担当の警官が過剰な暴力を行使したのではないかと疑われたが。
グレイヴヤードシフトは、シャーロック・ホームズのコスプレをして射殺された男性の事件を担当。グリッソムは、この事件をグレッグの最終テストとして捜査を任せる。スイングシフトは、車に乗ったまま木に激突して死亡した若者の事件を担当。不明な点がいくつかあったが、事件性の根拠が薄いことを理由に、エクリーから捜査終了を指示されてしまう。
スイングシフトは建設現場で2人の女性の遺体が発見された事件を担当。片方の被害者は失踪直前に顎を殴られて治療を受けており、夫がDVの疑いをかけられていた。ヘルプに入ったサラが捜査の手法をめぐってキャサリンと口論になる。グリッソムはサラを心配する。
グレイヴヤードシフトは、路上に乗り捨てられた車の事件を担当。持ち主には捜索願が出されており、車にはタイヤに細工された形跡があった。スイングシフトは、山中でクマに襲われて死亡したハンターの事件を担当。そばにはクマの死骸があったがネバダ州の野生種ではなく、しかも腹を裂かれ胆嚢を除去されていた。
グレイヴヤードシフトは山火事の事件を担当。天体観測をしていた男性と、もう1人女性の被害者が発見される。女性の方は全身に火傷を負っていたが奇跡的に生きていた。一方、スイングシフトは夫婦と5歳の娘の一家が殺害された事件を担当。捜査を進めるうち、この2つの事件に、意外な関連があることがわかる。
ブラス警部はある日突然、疎遠になっていた娘のエリーから電話を受ける。友だちがトラブルに巻き込まれたらしいというのだ。ブラスは休暇をとり、旧友が勤務しているロサンゼルス警察へと向かう。エリーの生活は、父親の想像以上に荒廃したものだった。
暴力的な傾向のある犯罪者ばかりを収容している精神病院で、患者の一人が殺害された。その病室は施錠されておらず、誰でも出入りすることが可能だった。グリッソムとサラが現場に向かう。
至近距離から頭を撃たれて殺害された女性がいた。バーで被害者に話しかけていた男の特徴を知り、キャサリンは動揺する。
匿名の通報を受けて現場に向かったCSIが、警官が目を離した隙に誘拐される。その後、100万ドルの身代金要求とともに、そのCSIが透明な箱の中に閉じ込められているライブ映像が送られて来る。グレイヴヤードシフトもスイングシフトも全員一丸となって捜査にあたる。