本日の0.6.12.0.1アップデートにて不具合を発見いたしましたので報告いたします。
詳細:件名の通りです(但し、新規の艦長を採用は可能な模様)。クライアントを再起動したり整合性をチェックしたりもしましたが結局変わりありませんでした。フレンドの方に話を聞いてみたところ同様の現象が発生してるようなので、どうやら個人の問題ではなさそうです。
もし使われているようでしたら、一旦外した状態でクライアントを再起動後、艦長の載せ替えを試してみてください。
情報ありがとうございます。ご指摘の通りMODに問題があるようでした・・・。