紋別港の整備は大正12年に着手し、昭和50年の重要港湾への指定を契機に商港としての整備が進められ、平成14年には多目的国際ターミナルの拠点施設となる岸壁(-12m)が供用され、大型国際貨物船への対応が可能となり、石炭の輸入港として物流効率化に貢献している。
更に、第3埠頭において5万kwの発電能力を有する木質バイオマス発電所が平成28年12月1日より本格稼働を開始し、港湾物流や交流空間などの港の機能に加え、エネルギー供給基地として利用されるなど、港湾の利用が促進されている。