長崎大学熱帯医学研究所は、その総合目標を、「熱帯地域に存在する複雑多様な自然社会環境が、熱帯病をはじめとする錯綜した健康問題を引き起こし続けている。国際交流の進展が著しい今日、これらの問題は世界的視野に立って解決されなければならない。長崎大学熱帯医学研究所は、上述の認識に基づき、熱帯病の中でも最も重要な領域を占める感染症を主とした疾病と、これに随伴する健康に関する諸問題を克服することを目指し、関連機関と協力して以下の項目の達成を図るものである。」と定め、以下の3項目を達成項目として掲げている。
可能な限り本計画に参画させ実地トレーニングを行う。基本的にベトナム側研究者が指導を行うが、日本側が得意とする分子生物学的手法などについては、日本側参加者が現地に赴いている際に実地指導を行う。また、日本で開催する合同シンポジウムへの積極的な参加と発表を推奨するため、研究テーマを与えて研究指導を行う。研究能力の底上げのため、可能であれば、長崎大学がJICA と共同で実施中の熱帯医学修士課程への進学や、優秀なものには、博士課程への進学、あるいはJSPSの論博事業への参加を促す。