このレシピは、優れたパフォーマンスを達成するため、インテル® プロセッサーおよびインテル® (スケーラブルな分子動力学コード) を準備、ビルド、実行する手順を説明します。
IFS パッケージによってインストールされる ライブラリーを使用するか、手動でダウンロードしてビルドすることができます。
インストールされている のバージョンをチェックするには、"f_info コマンドを使用します (ここでは、OFI1.4.2 を使用)。
"hosts" ファイルでバイナリーを実行するホスト名を指定します。
タスクを起動します。例えば、N ノード、ノードごとに コアの場合、次のコマンドを実行します。
マルチコードで優れたスケーリングを達成するには、通信スレッドの数を増やします (1、2、4、8、13、17)。例えば、次のコマンドは、ノードごとに プロセス、プロセスごとに を指定します。
デフォルトでは、PMI の両方で交換が行われます。このフラグがオンの場合は、PMI でのみ交換が行われます。