コピーやFTPのアップロード時に複数ファイルを選択する方法を調べていました。gulpのsrcはglob形式で指定できます。
dot:true オプションを指定すると、ドットを通常のキャラクターと同様に扱うことができます。
options.baseを指定すると、destで出力する場合に、どのフォルダーからコピー対象かが指定できます。詳しくはリンク先の例を参照のこと。
複数のファイルをsrcで指定するにはglobパターンを使って指定するか、配列にして指定します。例えばadminフォルダー内のhtmlファイルとjsファイルを指定したい場合は以下のようにします。