1930年代のフランス、パリ。父を火事で失ったヒューゴは駅の時計台に隠れ住み、駅の時計のネジを巻いて毎日を過ごしていた。ひとりぼっちのヒューゴの唯一の友達は、亡き父が遺した壊れたままの"機械人形"。その秘密を探るうちに、ヒューゴは機械人形の修理に必要な<ハート型の鍵>を持った少女イザベルと、過去の夢を捨ててしまった老人ジョルジュに出逢う。
時計台に隠れ住むなんて秘密基地に住んでるみたい。子供の頃にそういうのに憧れたなぁ、機械人形を動かすなんてのも子供の頃に憧れた気がするなぁ。ヒューゴの場合は臨んでそういう生活を選んだわけじゃないけどね。