なお、上述した「迷惑ソフト」ですが、これは様々なモノがあります。例えば、ユーザーが望んでいない広告を強制的に表示する「アドウエア」や、海外などへ勝手にダイアルアップ接続する「ダイヤラ」などがあります。これらは、ワームのように増殖はしませんし、プログラムをパソコンにインストールする際、勝手にインストールせず、パソコンユーザーの許可を取るものも少なくありません。
あと、ソフトに付属されるアドウエアなどは、開発費を抑えるためという大義名分がありますので、これらを一概にウイルスと同等には扱えない訳です。これらの迷惑ソフトは、ウイルスと区別するためにグレーゾーンのソフトウエアという意味で「グレーウエア」と呼ばれることもあります。
マルウエアは、商用ソフトであってもマルウエアと判断されることもあります。例えば、米ソニーBMG・ミュージックエンターテイメントが、2005年に出荷した音楽CDにコピー防止ソフト「XCP」を入れていました。この「XCP」は、パソコンのシステムを改変して自分の存在を隠す仕様になっているため、ウイルスなどの攻撃を受けやすくなります。そのため、商用ソフトではあるのですが多くのベンダーがマルウエアとして扱っていました。このように、マルウエアは立場によっても判断が分かれる微妙な立場にあります。