私たちは免疫染色の条件検討を行う場合、通常はパラフィン切片を用いて行います。
ただ、そうは言っても免疫染色の情報が無い抗体や自家製抗体などは、凍結切片を用いて特異性の検討を行うことも多々あります。
前処理としての固定方法によりバックグランドが抑えられたり、特異性が変わることもあります。
同じ話になりますが、特異性を判断する上で重要なのはウエスタン、定量PCR、ネガコン組織の染色、ISHなど、色々なデータを総合して判断することです。