会社の指揮命令下に置かれていることが労働時間の原則です。したがって,社員が勝手に仕事を持ち帰っても労働時間とはならず,会社が残業代を支払う義務はありません。
ただし,業務時間内では明らかに終えることができない量の業務を指示された社員が仕事を持ち帰らざるを得ない場合,社員が仕事を持ち帰っていることを上司が知っていながら放置している場合には,労働時間とみなされることがあります。無理な業務指示の結果,過重労働による労災の原因として認められるケースがあります。
会社にとっては,持ち帰り残業は,情報漏洩の原因,労災裁判の原因になりやすく,リスクが高いものです。社員の勝手な持ち帰りを全面禁止はできないものの,できるだけ禁止の方向で対策を取るべきであり,黙認は後の問題を考えるとお勧めできません。どうしても持ち帰り残業が必要な場合は,本人の同意が得られ,情報管理がしっかりできる条件の下で行うことが大切です。