競泳の大会には短水路と長水路を利用したものがありますが、ジャパンオープンは50mプールで行われる長水路の国内大会です。日本全国から選ばれた選手が参加をし、この大会で上位の成績を収めることができれば、国際大会へ出場できる権利をえられる可能性もあります。
ジャパンオープンは日本中の精鋭が出場しますが、同時にパンパシフィック大会とアジア大会の選考会を兼ねて行われることもあり、オリンピックが直前の時期には、その選考会を兼ねることもあるでしょう。