毎年春に活発に運ばれてくる黄砂には、炭酸カルシウムなどアルカリ成分が多く含まれている。さらに炭素状の粒子、有機物、重金属など、いろいろなものが運ばれてくる。
今後アジア大陸でNOx発生源が増えれば日本国内の清浄域にもオゾン汚染が深刻となる可能性がある。2004年6月、富山県内に光化学スモッグ注意報が発令されたときの天気図をみると、大陸からの影響を相当受けていたのではないかと考えられた。
最近、アメリカでの対流圏オゾンの増加はアジアの汚染が原因であるとアメリカの研究者が学術雑誌に発表しその後日本の研究者が東アジアのオゾンの増加はヨーロッパが原因であるなど、風上側の原因を指摘したものが学術雑誌に掲載されたりしている。今後、対流圏オゾン問題は一国では解決できず、国際的な政治問題になるのではないだろうかといわれている。
全国123地点の各都市における黄砂の年間延べ観測日数を見ると、2000年~2002年の3年間は日本国内の黄砂が非常に多かったが、2003年は急激に減少した。黄砂現象の発生には、大きな周期性があるのではないかと考えている研究者もいるようである。
さらに、黄砂のような土壌粒子が太平洋東部や大西洋にまで運ばれているという研究例もあり、特に外洋の植物プランクトンに必要な鉄などの栄養分を供給しているものと考えられている。洋上には植物プランクトンに必要な窒素やリンといった栄養塩は充分存在しているが、鉄分が不足している。黄砂などの鉱物ダストや土壌粒子が不足している鉄分を供給することでプランクトンが発生し、光合成が活性化するものと考えられている。そのため、二酸化炭素を大気から海に移動することができるものと考えられる。
また、黄砂粒子は炭酸カルシウムなどのアルカリ成分を豊富に含んでいるため、酸性雨を緩和する効果がある。2001年~2003年まで富山市天文台で採取した降水中のカルシウムイオン含有量とpHの変化のデータを見ると、秋季から冬季にかけて酸性雨が降っているが、春季には黄砂が酸性雨の緩和に効果的に働いている。北京などで降る雨は、二酸化硫黄の発生源に近く、硫酸イオンを豊富に含んでいるが、黄砂の効果のため酸性雨が中和されていると考えられている。
また、森林被害の原因は非常に複雑で、酸性雨、酸性霧も一つの原因とされているが、ほかにも地球温暖化の影響、生態自身の問題など、さまざまな問題があり、現時点では原因を断言することはできない。