আর কিছু অ্যালার্জিবিদদের অনুমান অনুযায়ী এল নিনো ততটা সমস্যার কারণ হবে কি না, সেই বিষয়ে অনেক বিতর্ক রয়েছে।
একই অ্যালার্জিবাদীরা যারা এল নিনোর ব্যাপারে ভুল ছিল, তারা ভবিষ্যৎবাণী করছে যে এল নিনোর সমস্যা হবে।