ভ্যাটিকান জাদুঘরের ৭ কিমি (৪ মাইল) কক্ষ এবং গ্যালারীগুলি আটটি যাদুঘর, পাঁচটি গ্যালারী, অ্যাপোস্টোলিক লাইব্রেরি, বোর্জিয়া অ্যাপার্টমেন্ট, রাফায়েল স্ট্যানজ (বা কক্ষ) এবং অতুলনীয় সিস্টিন চ্যাপেল নিয়ে গঠিত।
ভ্যাটিকান জাদুঘরে পাঁচটি গ্যালারি রয়েছে।