এজেন্সিগুলির মিশনে পার্থক্য এবং গুণগত ও পরিমাণগতভাবে ঝুঁকির মাত্রা নির্ধারণে অসুবিধা থাকার কারণে ব্যবহৃত নির্দিষ্ট ঝুঁকি বিশ্লেষণ পদ্ধতিটি এজেন্সিগুলির দ্বারা পরিবর্তিত হতে পারে।
যে ঝুঁকি বিশ্লেষণ পদ্ধতি ব্যবহার করা হয় তা প্রতিটি সংস্থার জন্য সমান।