৮ আইআরএস সিস্টেমগুলির আধুনিকীকরণের চ্যালেঞ্জগুলির মধ্যে রয়েছে ভবিষ্যতের আধুনিকীকরণের প্রচেষ্টাগুলি সংজ্ঞায়িত, পরিচালনা এবং নিয়ন্ত্রণ করার জন্য একটি আধুনিকীকরণ ব্লুপ্রিন্ট সম্পন্ন করা এবং আধুনিকায়িত সিস্টেম তৈরি ও অর্জনের জন্য ব্যবস্থাপনা ও প্রকৌশল দক্ষতা প্রতিষ্ঠা করা।
চ্যালেঞ্জগুলি আইআরএস থেকে এফবিআই এবং সিআইএ পর্যন্ত বিস্তৃত।