টোকুগাওয়া শোগুনরা খ্রিস্টধর্মকে নিষিদ্ধ করার পরে এবং নাগরিকদের বৌদ্ধ হিসাবে নিবন্ধনের আদেশ দেওয়ার পরে চীনা (১৬২০) দ্বারা নির্মিত জেন বৌদ্ধ মন্দিরগুলির মধ্যে কোফুকুজি মন্দিরটি ছিল প্রথম।
কোফুকুজি মন্দিরটি ১৫০০ সালের শেষের দিকে চীনা দ্বারা নির্মিত হয়েছিল।