কিছু দূষকের জন্য প্রাসঙ্গিক জটিল বায়ুমণ্ডলীয় রসায়নকে স্বীকৃতি দেওয়ার পাশাপাশি, বায়ুর গুণমান মডেলারদের পরিবর্তনশীল আবহাওয়াবিজ্ঞান এবং নির্গমনের স্থানিক ও সাময়িক বিতরণের সাথে সম্পর্কিত অনিশ্চয়তাগুলিও মোকাবেলা করতে হবে।
এটি গুরুত্বপূর্ণ যে বায়ুর গুণমান মডেলাররা বিভিন্ন ভেরিয়েবল অ্যাক্সেস করতে সক্ষম।